L’altare, già eretto nel 1491 a spese di Emiliano Scarognini, fu il primo luogo ( contiguo all’eremo del Santo Sepolcro abitato in origine dai Francescani), dove officiò Bernardino Caimi. Il vano era corredato da un preziosissimo ciclo di affreschi di Gaudenzio Ferrari, andato perduto. Sull’altare vi era la tavola con San Francesco che riceve le stigmate, dipinta dal Ferrari, tavola che ora si trova in Pinacoteca di Varallo.
L’attuale affresco sull’altare con la Morte di san Francesco è di Pier Celestino Gilardi, eseguito per committenza di Benedetta Totti Durio di Civiasco ( 1880 ). Gli ornati sono di Andrea Bonini di Varallo. Il cancello, in ferro battuto, è opera di Giovanni Martinetti ( 1704 ).
